Les cours d'eau sont classés selon les espèces de poissons que l'on y trouve.
Toutes les rivières gérées par le SDCBS sont classées en 2ème catégorie à l'exception de la Calonne qui est classée en 1 ère catégorie depuis le 1er janvier 2019. Elle possède en effet une population naturelle de truites fario.
On notera également dans nos rivières la présence d'espèces « étrangères » introduites par l'homme dans les étangs de la Dombes ou dans les rivières. Parmi elles on retrouve le poisson chat, le pseudorasbora ou encore la perche soleil.
A noter qu'il est interdit de relâcher ou de transporter vivantes ces espèces.