Avec la création de la compétence Gestion des Milieux Aquatiques et Prévention des Inondations (GEMAPI) par la loi en 2014, ce sont désormais les communautés de communes qui siègent et adhérent au syndicat.
Le comité Syndical vote le budget et décide des grandes orientations et décisions, notamment concernant les actions à conduire. Il est composé de 50 délégués dont 25 titulaires et 25 suppléants :
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